MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16F

Total Repeats: 280

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021518	TTTC	2	8	24	31	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021518	AAG	2	6	49	54	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021518	CATAAT	2	12	57	68	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021518	ACT	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021518	CCT	2	6	291	296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021518	ATT	2	6	335	340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021518	TTC	2	6	375	380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021518	ACTA	2	8	390	397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021518	GAC	2	6	422	427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021518	CTT	2	6	442	447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021518	CAC	2	6	462	467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021518	TTA	2	6	770	775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021518	ATT	2	6	893	898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021518	TA	3	6	968	973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021518	TACC	2	8	1019	1026	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021518	TCC	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_021518	TA	3	6	2652	2657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021518	TTAA	2	8	2667	2674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021518	TAG	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021518	CCT	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021518	A	6	6	3919	3924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021518	ATTT	2	8	3986	3993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021518	ATA	2	6	4006	4011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021518	TCT	2	6	4169	4174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021518	TAT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021518	TAG	2	6	5109	5114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021518	T	6	6	5125	5130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021518	TAT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021518	A	6	6	6116	6121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021518	CTT	2	6	6784	6789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021518	ACT	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021518	TAT	2	6	6895	6900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021518	TA	3	6	6970	6975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021518	TCA	2	6	6985	6990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021518	AACA	2	8	7028	7035	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021518	TTG	2	6	7096	7101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021518	TTG	2	6	7123	7128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021518	ATC	2	6	7137	7142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021518	ACT	2	6	7290	7295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021518	CAA	2	6	7324	7329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021518	AGC	2	6	7349	7354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021518	ACC	2	6	7374	7379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021518	GCT	2	6	7383	7388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021518	CTA	2	6	7465	7470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021518	GCC	2	6	7488	7493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021518	TAA	2	6	7523	7528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021518	CA	3	6	7551	7556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021518	TGC	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021518	AAGT	2	8	7585	7592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021518	CAG	2	6	7597	7602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021518	CAG	2	6	7609	7614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021518	CAA	2	6	7631	7636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021518	A	6	6	7686	7691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021518	TTAAC	2	10	7699	7708	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021518	ACC	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021518	CAT	2	6	7792	7797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021518	T	7	7	10241	10247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021518	CTT	2	6	10317	10322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021518	CA	3	6	10368	10373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021518	A	6	6	10408	10413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021518	TTG	2	6	10743	10748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021518	TTCG	2	8	10821	10828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021518	T	6	6	10880	10885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021518	ACC	2	6	10919	10924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_021518	ATT	2	6	10941	10946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021518	AAT	2	6	10960	10965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021518	CTTCA	2	10	10983	10992	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_021518	TTTA	2	8	11039	11046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021518	A	6	6	11072	11077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021518	ATA	2	6	11518	11523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021518	ACT	2	6	11574	11579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021518	TAA	2	6	11592	11597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021518	TCA	2	6	11629	11634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021518	TAG	2	6	11663	11668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021518	AGC	2	6	11697	11702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021518	TTA	2	6	11764	11769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021518	TAA	2	6	11770	11775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021518	ATT	2	6	11808	11813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021518	GTT	2	6	11875	11880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021518	ACT	2	6	11889	11894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021518	TTGC	2	8	13940	13947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021518	ATT	2	6	13959	13964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021518	GAA	2	6	14000	14005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021518	CAT	2	6	14024	14029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021518	AAG	2	6	14045	14050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021518	A	6	6	14711	14716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021518	T	6	6	14751	14756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021518	CCT	2	6	15845	15850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021518	AAGC	2	8	15859	15866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021518	ACT	2	6	15963	15968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021518	A	8	8	16210	16217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021518	ATT	2	6	16250	16255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021518	TAT	2	6	16261	16266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021518	GTTC	2	8	16409	16416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021518	AT	3	6	16450	16455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021518	TAA	2	6	16470	16475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021518	ACA	2	6	16524	16529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021518	AAT	2	6	16543	16548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021518	GAA	2	6	19610	19615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021518	TTG	2	6	19626	19631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021518	A	6	6	19653	19658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021518	GTT	2	6	19691	19696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021518	TAAA	2	8	19708	19715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021518	A	6	6	19713	19718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021518	TGC	2	6	19784	19789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021518	GTA	2	6	19802	19807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021518	TTA	2	6	19823	19828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021518	CGG	2	6	20198	20203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021518	GTG	6	18	22072	22089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021518	TTC	2	6	22091	22096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021518	ATT	2	6	22098	22103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021518	AATA	2	8	22125	22132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021518	TAA	2	6	22385	22390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021518	AGA	2	6	22395	22400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021518	AAG	2	6	22402	22407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021518	TAA	2	6	22416	22421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021518	CTAAA	2	10	23282	23291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021518	AAAG	2	8	23300	23307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021518	CAA	2	6	23643	23648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021518	AGG	2	6	23657	23662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021518	T	8	8	24631	24638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021518	TTA	2	6	24650	24655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021518	TCCA	2	8	24669	24676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021518	GAG	2	6	24723	24728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021518	GAA	3	9	24729	24737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021518	ATAA	2	8	28024	28031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021518	AAG	2	6	28067	28072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021518	GAA	2	6	28124	28129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021518	GCT	2	6	28130	28135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021518	T	6	6	28193	28198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021518	TGG	2	6	28221	28226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021518	TTC	2	6	28243	28248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021518	T	6	6	28257	28262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021518	CGA	2	6	28309	28314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021518	TCA	2	6	28325	28330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021518	ATC	2	6	28350	28355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021518	TC	3	6	28390	28395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021518	CCT	2	6	28981	28986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_021518	TTGT	2	8	28991	28998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021518	CTTT	2	8	29336	29343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021518	TTTAG	2	10	29352	29361	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021518	TTCT	2	8	31160	31167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021518	TCTT	2	8	31239	31246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021518	T	6	6	31296	31301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021518	CTT	2	6	31357	31362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021518	ATC	2	6	31364	31369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021518	AAT	2	6	31371	31376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021518	CAC	2	6	31381	31386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_021518	TGT	2	6	31505	31510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021518	ATT	2	6	31705	31710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021518	TGGA	2	8	31722	31729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021518	T	6	6	32272	32277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021518	A	7	7	32610	32616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021518	TAT	2	6	32666	32671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021518	CTG	2	6	32704	32709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_021518	ACG	2	6	32722	32727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_021518	ATTG	2	8	33185	33192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021518	A	6	6	33207	33212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021518	T	6	6	33294	33299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021518	GTC	2	6	33322	33327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_021518	CAG	2	6	33407	33412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_021518	TCAC	2	8	33417	33424	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_021518	GTTA	2	8	34351	34358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021518	AAAAG	2	10	34378	34387	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_021518	TGG	2	6	34552	34557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021518	AGC	2	6	34565	34570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_021518	CTT	2	6	34610	34615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_021518	CCA	2	6	35166	35171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_021518	GTG	2	6	35196	35201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021518	ACGA	2	8	35229	35236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
174	NC_021518	TCG	2	6	35264	35269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_021518	T	7	7	35281	35287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021518	TAA	2	6	35298	35303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_021518	T	6	6	36453	36458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021518	ATT	2	6	36475	36480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021518	CTT	2	6	36507	36512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_021518	ACC	2	6	36836	36841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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186	NC_021518	T	6	6	37227	37232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021518	TTC	2	6	37321	37326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_021518	GTC	2	6	37327	37332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_021518	T	6	6	37554	37559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_021518	GGC	2	6	37586	37591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_021518	CTTT	2	8	38011	38018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
198	NC_021518	T	7	7	38016	38022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_021518	TTGAC	2	10	38032	38041	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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228	NC_021518	T	6	6	45580	45585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_021518	ATT	2	6	47107	47112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_021518	AT	3	6	47185	47190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_021518	AC	3	6	47203	47208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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279	NC_021518	TGA	2	6	50104	50109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_021518	CAT	2	6	50177	50182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.